在靜謐的生活中，俵家似乎已遠離了忍者的世界，然而，過去的陰影始終如一地徘徊不去。當BNM（忍者管理局）再次找上門來，俵家再次被捲入一場未知的風波。

過去的俵家，曾為了解救被綁架的政治人物向井瞳子，與風魔忍者激戰。晴在與風魔忍者的對決中，雖然取得了勝利，但在對方求饒時卻未能下手致命一擊。這個決定，間接導致了長子岳的死亡，讓他成為了蒙面忍者的犧牲品，屍體沉入冰冷的海中。這事件，讓俵家決定從忍者的世界隱退，過著普通人的生活。

然而，生活並未如俵家所願那般平靜。父親壯一雖然表面上專注於自家釀酒事業，但財務狀況卻不順利。母親陽子對平淡無味的家庭生活感到厭倦，並反覆在超市進行扒竊。凪則被京谷告白，但她拒絕了，反而對偷走藝術品後再歸還的行為產生了濃厚的興趣。而晴，則在從事自動販賣機的補給工作的同時，每天夜晚都會去他常去的牛丼店，那裡有一個名叫伊藤可憐的女性，成為了他生活中的一大樂趣。

然而，當BNM的浜島再次找上門來，請求壯一調查最近發生的遊覽船上所有乘客死於毒物的事件時，俵家再次被捲入風波。壯一拒絕了這項請求，表示「不再讓家人陷入危險之中」。但事情並未因此結束，可憐的真實身分被揭露為記者，而她的行為也引起了晴的注意。

晴原本與可憐有約，但約定的晚餐被取消後，晴決定跟蹤可憐。他發現了可憐戴上面具前往俱樂部與一個叫秋山的男子會面，收集關於遊覽船事件的情報。從他們的對話中，晴得知有一名乘客在該事件中倖存，並被懷疑為兇手。然而，當秋山提到「黃色的花…」時，他被刺客殺害。刺客隨後試圖攻擊可憐，但晴及時出現，與刺客展開激戰。

在激烈的戰鬥中，刺客受了傷逃到了外面。就在晴追出去的時候，刺客被一輛車撞死。然而，晴發現死者並沒有他留下的手臂傷痕，證明這是一個替身，真正的刺客已經逃脫。此時，新興宗教元天會的教主辻岡也在附近的俱樂部附近出現，這一切似乎都與他有著千絲萬縷的聯繫。

另一方面，凪在偷拍藝術品照片後，將其發佈到了社交媒體上。突然，有一個陌生人關注了她，並詢問她「你自稱忍者？」。這個神秘人的出現，讓俵家的生活再次陷入了混亂。