在印尼雅加達，真菌學教授伊布·拉特納接到警察局的傳喚。當他得知本地一家麵粉穀物工廠發生了感染爆發事件時，他的心中已經預感到一絲不祥。迅速趕到了現場，並在解剖了一具被真菌感染致死的遺體後，他的擔憂變成了恐懼。

這位久經沙場的真菌學家深知，這次爆發的感染並非尋常疾病。在顯微鏡下，那些曾經熟悉無害的真菌如今已經變得猙獰可隘，它們以驚人的速度繁殖，侵蝕著每一個生命體。伊布知道，如果不盡快採取行動，整個城市，甚至整個國家都可能陷入這場災難。

他提出了一個大膽而極端的建議——轟炸城市。儘管這聽起來近乎瘋狂，但伊布堅信這是阻止感染擴散的唯一方法。然而，政府並沒有採納他的建議，他們擔心這樣做會造成更大的傷亡和混亂。

另一邊，喬爾和泰絲正陪伴著一位看似平凡卻隱藏著巨大秘密的少女──艾莉。她感染了這種真菌，卻奇蹟般地沒有症狀。他們被告知，艾莉的身體裡蘊含著對抗這種真菌的免疫力，她是研發疫苗的關鍵。然而，喬爾對這個說法持懷疑態度。

三人穿越被感染者佔據的城市，朝著議會大廈前進。他們的目的地是火螢組織，一個致力於尋找解決方案的秘密組織。但是，當他們到達大廈時，卻發現所有的火螢成員都已經喪生，其中一人甚至因為感染而變得瘋狂，引發了同伴間的自相殘殺。

泰絲在絕望中透露了自己也被感染的消息，而艾莉的傷口卻開始癒合，這證明了她確實具有免疫力。喬爾不得不面對現實，他開槍殺死了一名已經變成感染者的火螢成員，但他不慎觸發了真菌纖維，引發了更大的混亂。

泰絲明白，他們已經沒有退路。她決定犧牲自己，為喬爾和艾莉爭取逃脫的時間。她建議喬爾帶著艾莉去找他們共同的老熟人，也許那裡還有一線生機。

當喬爾和艾莉離開時，泰絲將整個大廳倒滿了汽油。當感染者們破門而入時，她引燃了汽油，與那些可謙的生物一同消失在火海中。

喬爾帶著艾莉繼續前行，他們的目的地越來越近。