韓劇《夜晚開的花》講述守寡15年的寡婦趙汝花（李荷妮飾）與天生自帶衰減，即將與17歲少女成親的禁衛營從事官樸秀浩（李鍾元飾）相遇展開的搞笑搜查故事。

趙如花（李荷妮飾），擁有兩種面貌，白天她是端莊的烈女，也是士大夫名門家族的兒媳，在看不見外面世界的圍牆內安靜的生活著。到了夜晚，她就會翻過圍牆，在無人知曉的情況下幫助他人。而擁有出色武藝又聰明頭腦的朝鮮完美男樸秀浩，在遇到擁有雙面人生的趙汝花後捲入了意想不到的事件中。

樸秀浩（李鍾元飾）,秀浩是個擁有帥氣外貌，工作優秀，是都城中最受歡迎的男子。從小就倒楣的他在尋找父親當年慘遭殺害的原因時，偶然遇到了女主角和他一起尋找真相。

另外，石智星（金相中飾）、樸允鶴（李己雨飾）、延善（樸世賢飾）。

故事一開始，女主角如花就是一個身手俐落的華麗登場，這位全身黑衣的蒙面神秘人，為了可憐的小女孩而走險來到賭場，怒抓嗜賭成性還想變賣家產的女孩父親，結果意外地與正在臥底調查的禁衛營從事官秀浩，沒想到初次見面就來個夢幻的轉身入懷，還讓兩人對彼此上了心。

逃出賭場的如花，一個箭步回到大宅裡，原來她竟是朝鮮最高名門的長媳，但還沒見過丈夫一面的如花就直接成了寡婦，就此守寡至今15年，更被婆婆要求苦守祠堂修身養性。

如花表面是個大門不出、二門不邁的貞節烈女，到了夜晚卻化身黑衣人，到處行俠仗義；其實，如花從小父母雙亡，與親哥哥兩人相依為命，但某天哥哥因急事入宮後就再也沒有回來，從此音訊全無。腹黑的家族長輩執意將她嫁到左相家來謀取好處，卻因迎娶當天丈夫身亡而被冠上克夫之名，還守寡十多年，為了保護更多像自己一樣命途多舛的人，而在夜晚神出鬼沒、行俠仗義。

正查找神祕女子的秀浩得知，每晚女人都會飛簷走壁，到處幫助窮苦之人，他沒曾想過能遇上一個和自己理念相同的人，秀浩真心地想見這位正義女俠客一面；秀浩也有一段悲傷的兒時記憶，從小就倒楣的他，某天家裡突然來了一群黑衣刺客，將他父母都殺害，自己也命懸一線。

某天，來寺廟祭拜雙親的秀浩巧遇正準備前往寺廟為兄長祈福的如花，還誤以為如花遭遇搶劫，正義感爆棚的秀浩正想來個英雄救美，如花又再度掉進愛的懷抱中，但秀浩卻沒曾想過，懷中的女子竟是自己領命要抓捕的逆賊？

秀浩決心追查到底，他拿著如花的鞋子作為證據來到了明道客棧。儘管老闆娘昭雲承認自己與戴面具的人有過接觸，但她並沒有透露如花的真實身分。然而，秀浩卻異常執著，誓要揭開如花的真面目。同時，允學也警告秀浩遠離危險人物必直。然而，秀浩對必直的興趣卻越來越濃厚，因為他覺得自己在某個地方見過這個人。

商人姜必直在高層編織自己的關係網，他常常以賄賂換取那些腐敗者的庇護。其中一個被他牢牢控制的高官，便是那位聲名狼藉且極度虛榮的財政大臣廉興集。這位大臣的暴行令人髮指，他竟因一滴水濺到自己的虎皮畫上而殘忍地毆打一名老僕人，幾乎將其打死。

如花在聽聞此事後，義憤填膺，她潛入廉興集的府邸，以其人之道還治其人之身。當廉興集發現那幅心愛的虎皮畫被一幅惟妙惟肖的巨型家貓素描取而代之時，他的心臟幾乎承受不住這巨大的打擊。而此時的秀浩，已開始對這起離奇的竊案展開深入調查。目擊者的證詞紛紛指向了一個戴著面具的神秘女子，她似乎成為了這起案件的關鍵人物。

秀浩和允學前往寺廟，為秀浩的生父母舉行追悼會。在一段閃回中，秀浩的家庭遭到屠殺，這血腥的一幕似乎與十五年前的某個事件緊密相連。同時，如花也來到了這座寺廟，她默默祈禱著哥哥能夠平安歸來。然而，命運似乎並不眷顧她，她遇到了土匪的伏擊。

在這危急時刻，秀浩和允學正好趕到現場。秀浩英勇地與土匪展開了激烈戰鬥。不出所料，電視劇中的經典橋段再次上演，英雄在危險中救出了女主角，而如花不知怎地最終落入了他的懷抱。兩人在旁白的慢動作中旋轉著。

秀浩發現商會會長薑必直也在尋找汝華從戶曹判書那裡偷走的那幅畫。他在明道客棧給蒙面英雄留下了一張紙條，以示警告。與此同時，汝華和她的婆婆以及高官們的妻子們一起參加了一個救濟活動，突然有一個孩子失踪了。

秀浩來到明道客棧修復畫作，卻意外撞上了蒙面英雄。她告知他，姜必直一直在貧民窟綁架孩子。身為首都防衛的官員，秀浩決定親自處理此事，並要求她不要再插手。同時，國王和尹赫在尋找已故國王的侍衛成員。

汝華和秀浩找到了姜必正藏匿被綁架孩子的地方。兩人合作成功解救了這些孩子，但對於孩子們的下一步如何安置，兩人產生了分歧。秀浩主張將孩子們帶到首都防衛隊，作為姜必直犯罪的證人，而汝華則認為應先將孩子們安置到安全的地方。此時，戶曹判書意外過世，其僕人因謀殺嫌疑被捕。

秀浩得知了汝華的真實身分後，開始採取措施防止她做出任何輕率的舉動。同時，尹赫發現宋虎是前國王的侍衛，他十五年前收到前國王的密令後就失蹤了。而在尋找哥哥蹤跡的過程中，汝華意外地遇見了某個人。

國王與尹赫對智星接納車成浩的妹妹汝華作為兒媳感到奇怪。他們認為智星是把她當作人質來牽制自己。同時，智星邀請尹赫和秀浩到家中作客。同時，南景想私下和汝華談談她的家庭狀況。

秀浩開始調查南景的背景，同時，汝華也從南景得知，哥哥的失蹤與宮廷中的事務有關。汝華向智星詢問哥哥的下落，但智星試圖向她隱瞞真相。當智星在半夜偷偷離家時，汝華決定跟蹤他。

汝華從尹赫和秀浩那裡得知，智星讓她嫁入他家是為了控制她的哥哥成浩。此外，秀浩也向他透露了自己的真實身份和家庭背景。他們認為成浩手中握有智星叛亂的證據。同時，金玉離開家到寺廟為兒子祈福，而她的兒子石正回到家。

姜必直未能完成殺死南景的任務，試圖逃跑。智星決定在汝華發現更多關於他的陰謀之前將她除掉。同時，他也用太后的安全威脅國王。同時，秀浩發現智星的兒子石正活著回來了。

石智星發現秀浩是前國王衛隊隊長的兒子，石正請求秀浩與他私下交談。同時，國王邀請智星和他的家人到宮殿慶祝石正的歸來，而一位意外的客人正在等待他們。

汝華難以置信，自己的公公智星竟然已經殺害了秀浩。姜必直也坦白，智星命令他謀殺秀浩和尹康一家。儘管他的罪行已被家人揭露，他卻毫不在意，甚至試圖威脅國王。汝華氣得發瘋，決定立刻殺了他。