為了保護自己的結拜兄弟錦山以及心愛的女人由美，於是自願頂替錦山並扛下殺了自己組內老大的罪名，然後服刑十年後回到神室町的主角“桐生一馬”與為了找尋母親的神祕少女相遇。

這個女孩的名字叫做“遙”，同時她的手中掌握了一筆與東京第一大幫派·東城會有關而行踪不明的一百億元下落的關鍵資料，於是各方勢力為了這筆錢都因此盯上了這名少女。為了守護遙而戰的桐生，也在戰鬥中開始尋找何謂「人活著的意義」。

1995年， 桐生一馬和他的朋友們迫切想逃離充滿限制的生活， 計劃搶取一家當地的街機遊戲店。然而， 這家街機店屬於控制神室町的黑幫組織堂島組的管轄範圍。

 同時， 在2005年， 即將出獄的桐生從伊達警探那裡得知自己的朋友們身處險境後， 決定回到神室町保護他們。

 1995年， 經營向日葵孤兒院的風間原本希望桐生、錦山、由美和美穗能過正常生活。但事與願違， 四人最後都加入了黑幫。

同時， 在2005年， 近江聯盟因一起100億日圓的劫案與東城會的緊張關係逼近沸點。

1995年， 堂島組接近了埃德加的妹妹，她手上有出售埃德加的土地所需的印章。同時， 由美前往大阪尋找失散多年的姊姊。

在此期間， 圍繞埃德加印章的爭鬥愈演愈烈。2005年， 愛子突然失踪， 留下了她的女兒小遙。桐生和由美決定保護小遙， 但他們很快就發現了一個驚人的秘密。

1995年， 過度勞累的美穗重病纏身。阿錦因憂心妹妹的病情而陷入堂島的陷阱，被後者抓住自己的弱點操控利用。

2005年， 桐生和由美在大阪繼續尋找失蹤的愛子， 並遇到了近江聯合的會長鄉田。鄉田強迫他們承諾在隔天午夜前歸還那100億日圓。

2005年， 風間為了避免東城會與近江聯合爆發戰爭， 主動與近江聯合的鄉田會長會面。同時， 十年前桐生和阿錦之間的恩怨再度浮現， 讓兩人關係更加緊張。

1995年， 桐生為了籌集美穗的手術費用， 在地下拳賽中連連獲勝， 最終迎來了高額賭注的冠軍爭奪賽。

1995年， 桐生、阿錦、由美和美穗之間如同家人般深厚的關係最終悲劇性地破裂。

2005年， 桐生和由美能否阻止東城會與近江聯合之間的戰爭? 桐生和阿錦之間十年的恩怨如何化解? 新宿惡魔的真正身份又是什麼? 隨著局勢愈發緊張， 他們將在神室町迎來最終的決戰。