本劇改編自同名漫畫，以小學為舞台，講述了頭髮蓬亂、態度冷漠、頗愛抱怨的保健室校醫牧野，用自身的觀察力看穿“無法用語言表達的SOS”，幫助孩子們走向未來的暖心故事。

兒科醫生牧野（松下洸平）被派往東多摩第八小學當「校醫」。孩子們以及六年二班的班主任篠谷（森川葵）都對牧野的那句「盡量別來保健室」感到憤怒。牧野是大學醫院選派來進行學校常駐實驗的試點醫生，但他似乎另有隱情…

這天，和往常一樣，孩子王拓真（佟吾）發現後山禁入區有個很酷的秘密基地，便邀有興趣的宏哉（吉田奏佑）和大和（山口暖人）一同前往。身體本來就抱恙的拓真在草叢中突然倒下……與篠谷一同前往現場的牧野看到拓真的症狀後立刻判斷他得了某種病。

幾天後，篠谷向牧野諮詢總愛瞌睡的由紀（增田梨沙）的情況，坦言自己很難理解孩子的心事，結果兩人話不投機吵了起來。此時，有人告知他們由紀在操場上暈倒了…

在東多摩第八小學的體育館裡，正在為六年級的學生舉辦AED講座。面對似乎不太願意認真聽講的孩子們，牧野（松下洸平）訴說著生命的寶貴，而理子（中村たんぽぽ）卻對啓（岡本望來）所說的「牧野殺死了病人」這句話記憶深刻。

聽到囉和理子對話的孩子們開始散播一些不負責任的話，像是「不能去保健室」等等。篠谷（森川葵）指出牧野的平時的言行也可能是原因之一，但牧野完全不聽。在這種情況下，腹痛得無法忍受的的理子偷偷溜進了空無一人的保健室，被牧野發現。

理子因為身體除了腹痛之外，還有其他不適，不顧啓的勸告，向牧野求助。

牧野感受到理子的不安，再次向孩子們解釋忽視病情的危險性。這段期間，四年級的勇吾（湯田幸希）突然摀住胸口倒下……！
牧野立即進行緊急處理，但勇吾胸口疼痛的背後，卻隱藏著某個秘密。

牧野（松下洸平）知道了以前在醫院負責治療的病人·冴島直明（土屋陽翔）的姊姊就是6年2班的兒童·冴島啟（岡本望來）。啟為了愛慕牧野的直明，散佈保健室的壞消息，打算把牧野從小學趕出去，送回醫院。

牧野到小學赴任後，成為直明主治醫生的咲間（吉澤悠飾）告訴母親環等人，春天左右就能給直明做手術了。出院了的直明很高興，但是以孩子的身體狀況為第一考慮的母親不允許他去上學。

但是，好奇心旺盛的直明，趁環不在家的時候外出了。啟也跟著一起去了，但是潛入學校的直明卻瞞著啟去學校探險。同時，直明在學校遇到了想要進行怪談旅行而躲起來的拓真（柊吾）、宏哉（吉田奏佑）、大和（山口暖人），並與6年級的他們成為了「朋友」。另一方面，啟向學校裡唯一知道直明的牧野求助，和牧野一起尋找直明，但直明的身體狀況在學校探險途中逐漸惡化……。

六年級的野外住宿學校。3天2夜的共同生活，發現同學不知道的一面。牧野（松下洸平飾）毫不掩飾自己討厭的態度，筱谷（森川葵飾）一臉驚訝。

當兒童在非日常的空間裡坐立不安時，水本羽菜（小西希帆飾）一臉不悅。羽菜和在walk拉力賽中偏離路線行動的調皮兒童藤野一希（上田琳鬥），以及同班的女生都無法很好地融入。

讓羽菜煩惱的是7月的某個事件。全班同學努力製作的七夕裝飾，放學後被什麼人破壞得一塌糊塗。雖然被懷疑是犯人的是一希，但真正的犯人是羽菜。羽菜因為孤獨感而產生了破壞衝動。一希知道犯人是誰，卻一直保守這個秘密。但羽菜擔心一希會不會把真相告訴別人，在野外學校的時候也很在意……。

如果自己是兇手的身份被揭露了，班上就沒有立足之地了。就這樣羽菜衝動地把一希推到了河裡。目擊了現場的牧野，打算面對羽菜，但是一希和羽菜兩人從救護室逃走了…!

羽菜（小西希帆）因和父母的關係而受傷，被篠谷（森川葵）告知「已經處於自我崩潰的邊緣」的牧野（松下洸平）來到了羽菜的家中。牧野對羽菜說“我想幫助你”，其實牧野也有著屬於他自己的辛酸過往。

幾個月前，單親爸爸貴之（塚本高史）帶著兒子真琴（三浦綺羅）來到了牧野工作的大學醫院。牧野根據真琴的症狀和檢查結果診斷為流感，但兩週後高燒依然沒有退去，貴之再次帶著真琴來到醫院。聽高崎（田邊誠一）診斷說真琴是感染了其他細菌後，貴之對牧野的不信任感愈發強烈。儘管高崎建議牧野要更體諒病人和家屬的心情，但…

在此期間，牧野在查看真琴的病歷後注意到了發熱的原因，便不顧吉田（加藤千尋）的勸阻，執意給真琴家打電話。然而，被牧野的強硬態度嚇到的真琴直接掛斷了電話。此後，牧野聽說貴之取消了來院預約，便擅自強行將真琴帶到了醫院…

因為要應付監護人，還要準備活動，篠谷（森川葵）變得異常忙碌，就連睡懶覺都變得格外奢望，牧野（松下洸平）對此頗為關注。芳野（和冉千秋）和藤岡（平岡祐太）也擔心著首次擔任六年級班主任的篠谷，然而，不擅長依賴他人的篠谷，寫的「待辦事項」便籤卻越來越多。

在篠谷的班級裡，有一個由玲香（畠中一花）、遙（齊藤百花）和芽衣（涼川美春）組成的女生小團體，以及很少參與其中的凜（中田煌理）。然而，凜無法融入玲香她們的話題，例如流行的唇膏，或是去原宿遊玩等，使得凜感到有些被排斥。

就是這樣的背景下，因為篠谷沒收了玲香的彩色唇膏，玲香的母親直接闖到學校來興師問罪！篠谷持續遭受失眠和食慾不振的困擾，更在教室裡發現了一張寫著「和篠谷老師說話的人，要被整死哦」的字條，篠谷身心俱疲。有一天，在放學回家的路上，篠谷偶然在便利商店看到凜正盯著彩色唇膏看……！